본 발명은 친환경 폴리우레탄 복합소재를 이용한 다공성 수중방파제의 제작 방법 및 이를 통해 제작된 다공성 수중방파제의 시공 방법에 관한 것이다. 본 발명의 친환경 폴리우레탄 복합소재를 이용한 다공성 수중방파제의 제작 방법은 친환경 폴리우레탄 콘크리트를 제조하는 제1단계; 특수 섬유사를 친환경 폴리우레탄 복합소재에 함침 후 인발하고 성형하여 기초부와 기둥 및 빔을 제조하고, 상기 빔을 결합하여 격자망을 제조하는 제2단계; 및 상기 제2단계를 통해 제조된 기초부에 상기 기둥을 설치하고, 상기 기둥에 상기 격자망을 설치하며, 상기 기초부, 기둥 및 격자망이 내부에 위치하도록 거푸집을 설치 후 상기 거푸집의 내부에 친환경 폴리우레탄 콘크리트를 주입하고 양생시킨 후, 거푸집을 탈거하는 제3단계;를 포함한다. 따라서, 해저면에 안착되는 기초부가 일체화되어 있으므로, 시공이 용이하고, 오탁, 분진 발생을 최소화할 수 있어 민원의 소지를 없앨 수 있다.